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jModelTest

jModelTest的使用

下载地址,必须在java环境下运行。

菜单栏File > Load DNA Alignment选择你的文件。

菜单栏Analysis > Compute Likelihood Scores,因为用不到太多模型,也为了提高速度,将Number of Substitution Schemes改为3再点击Compute Likelihoods

菜单栏Analysis > Do AIC calculations全选后点击Do AICc calculations选择ML的最适模型。

菜单栏Analysis > Do BIC calculations全选后点击Do BIC calculations选择BI的最适模型。

菜单栏Results > Show Results Table根据AICc和BIC查看最适模型。

菜单栏Results > Build HTML log保存文件。

Last updated on 1 Dec 2020
Published on 1 Dec 2020

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